Karnabaharda tohumlar şekil ve renk bakımından lahana tohumlarına benzerler, ancak biraz daha küçüktürler. Karnabahar tohumları oval veya yuvarlak 2-3 mm çapında, açık kahverengi veya koyu kırmızı kahverengi renktedir.1 g’daki tohum sayısı 250-450 adettir. Karnabahar tohumlarının çimlenme gücü %90-95’dir.